Wie üblich zeigt Ihnen Hyperdia alle verfügbaren Zugverbindungen an. Achten Sie nur darauf, “Narita Airport Terminal 1” (oder 2) als Abfahrtsbahnhof zu wählen und nicht nur “Narita” (letzteres befindet sich in der Innenstadt von Narita).
Der Narita Express ist die einzige direkte Bahnverbindung zwischen dem Flughafen Narita und Shinjuku, aber auch die teuerste. Da billigere Alternativen jedoch mindestens einen Umstieg an einem zentralen Bahnhof in Tokio erfordern, würde ich das nicht empfehlen, es sei denn, Sie sind ein ziemlich erfahrener Benutzer der japanischen S-Bahn (und wenn Sie das wären, würden Sie diese Frage nicht stellen). Nichtsdestotrotz können Sie die günstigsten Zugoptionen finden, indem Sie das Kästchen “Limited Express” in Hyperdia deaktivieren. Dadurch werden die teureren limited express Züge, wie z.B. der Narita Express und der Skyliner, aus den Ergebnissen ausgeschlossen und nur die billigeren, normalen Pendlerzüge bleiben übrig.
Wie von Chris H. erwähnt, sind auch Limousinenbusse eine Option, die man in Betracht ziehen sollte, besonders wenn sie an oder in der Nähe Ihres Hotels halten.